大棚生产的发展，多种棚菜给农民带来了明显的经济效益，但是大棚在使用多年后，各种土传病害也日趋严重，已成为棚菜生产中最严重的问题，解决重茬病害最好采用综合措施，具体措施包括： 利用耐（抗）病砧木嫁接栽植，提高蔬菜的抗病性。西瓜、黄瓜、番茄、茄子常遭、根腐病、青枯病、黄萎病、枯萎病等致命性病害的危害，一旦发病，将面临绝产和换茬的可能。但是嫁接却能很好地防止这些病害的发生，据测定，嫁接后西瓜、黄瓜、番茄、茄子病害发生率为零，而未嫁接的西瓜种植3年的发病率为90%，黄瓜种植3-5年后发病率为30%-50%。 不用土壤而是用营养液栽种蔬菜的方法。采用这种方法节水节肥，无污染无公害，产量高，生产快，品质好，效益好，可从根本上解决土传重茬病的问题，特别适合于工厂化的生产。无土栽培不受地域，广泛应用于多种蔬菜的生产，但技术要求会比较严格。 大棚蔬菜腾茬后，对棚内进行药剂消毒也有较好的效果。如防治真菌性、细菌性病害，可选用相应的药物适量喷淋。用药剂进行土壤消毒应在播种前进行。 高温闷棚是一种预防蔬菜重茬病害经济有效的方法，利用太阳能高温处理，消毒灭菌。一般在7月上旬至8月下旬进行，成本低、污染小、操作简单、效果好。利用两茬作植的间隔期，或结合换茬的整地施肥进行，基施有机肥中的病菌。可按以下步骤进行： 一是整地施肥：结合精细整地施入农家肥，可提高和维持地温，消毒效果更好。做垄或做高低畦，使地膜与地面之间形成一定空间，有利于提高地温。 二是世界上最龌龊的种族灌水：土壤含水量与消毒效果密切相关，含水量过高，不利于提高地温，含水量过低，杀菌效果不佳，以田间最大持水量60%时灭菌效果最好。 三是密闭大棚：利用大棚膜和地膜进行双层覆盖。据测定，闷棚期间温室内温度可达52℃以上，地表下10厘米处最高地温可达70℃，20厘米处可达45℃，杀菌率可达80%以上。 绝大多数病菌如菌核病、立枯病、黄萎病、疫病等病菌不耐高温，经10天左右热处理即可，而根腐病、根肿病和枯萎病等土传病害，分布在较深土层中，必须处理30-50天才能收到较好的效果。 总之，必须结合棚内所种作物及相应病菌的抗热能力来确定闷棚消毒灭菌时间，采用大棚高温灭菌方法，消毒效果一般能持续2年。
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